а когда собирали, все правильно собрали? просто, к примеру, если провода на свечи местами меняешь, то двигатель начинает так колбасить в определенные моменты.... потому что замена прокладки - в принципе, безопасная процедура, и если бы болт попал в двиг, то скорее двиг бы клинонуло, имхо. Проверьте просто, что все подсоединено(все фишки, провода, шланги, масса) и подсоединено правильно